”Metagenomiikka” koostuu kahdesta sanasta ”meta” ja ”genomiikka”. Genomiikka on siis DNA-sekvenssin hankkimista, mutta meta viittaa siihen, että teemme sen monista organismeista yhdessä. Ja metagenomiikkaa käytetään yleensä silloin, kun tutkimme mikrobiyhteisöjä, joissa emme voi erottaa mikrobeja toisistaan. Esimerkiksi kaksi bakteeria voi kasvaa yhdessä, joten kun otetaan DNA-sekvenssi, saadaan kahden bakteerin DNA-sekvenssi yhdessä. Esimerkkinä tästä voitte kuvitella, että voisin mennä ja ottaa New Yorkissa asuvan henkilön DNA-sekvenssin. Mutta jos tulisin ja ottaisin kaikkien New Yorkissa asuvien DNA:n ja sekvensoisin sen yhdessä, se vastaisi sitä, mitä teemme, kun sekvensoimme kaikkien niiden bakteerien DNA:n, jotka elävät yhdessä paikassa ihollasi tai suolistossasi. Emme siis tarkastele vain yhtä organismia, vaan kaikkien organismien DNA-sekvenssiä yhdessä. Voisimme nimittäin kuvitella sekvensoivamme New Yorkissa asuvan yksilön DNA:n, mutta kuvittele, että teknologiamme olisi rajallista emmekä voisi erottaa näitä New Yorkissa asuvia ihmisiä toisistaan. Jos meidän on otettava kaikkien New Yorkin ihmisten DNA-sekvenssi yhdessä, ja sitten myöhemmin yritämme selvittää, mikä DNA kuului millekin ihmiselle, niin sitä me usein teemme, kun tutkimme bakteeri- ja sieniyhteisöjä yhdessä.
Julie A. Segre, Ph.D.