Foraminifera – The World Foraminifera Database

Nykyinen kelvollisten tuoreiden lajien määrä: 8 887
Nykyinen kelvollisten fossiilisten lajien määrä: 40 130
Nykyinen kelvollisten (fossiilisten + tuoreiden) lajien kokonaismäärä: 48 271

The World Foraminifera Database

Tämä maailmanlaajuinen tietokanta, joka sisältää kaikki koskaan kuvatut (tuoreet ja fossiiliset) foraminiferalajit, on osa World Register of Marine Species (WoRMS) -aloitetta, joka on maailmanlaajuinen aloite, jonka tarkoituksena on luoda rekisteri kaikista meren eliöistä.

Tietokannan haku (fossiiliset ja/tai viimeaikaiset lajit)

Oletusasetus on etsiä koko tietokannasta fossiilisia ja viimeaikaisia lajeja. Jos haluat etsiä vain viimeaikaisista (elävistä) taksoneista, rastita ”extant”-ruutu taksonihakuikkunassa.

Mitä ovat foraminiferat?

Foraminiferat (”reiänkantajat”), foraminiferat tai lyhyesti foramit, ovat suuri amoeboidaalisten alkueläinten (yksisoluisten) kantaryhmä, jolla on verkkomaiset pseudopodit, eli hienoja sytoplasmasäikeitä, jotka haarautuvat ja yhdistyvät muodostaen dynaamisen verkon. Ne muodostavat yleensä testin (tai kuoren), jossa voi olla yksi tai useampia kammioita ja joka on valmistettu kalsiumkarbonaatista (CaCO3) tai yhteen liimatuista mineraalirakeista tai muista hiukkasista. Testit ovat yleensä alle 0,5 mm:n kokoisia, mutta suurimmat voivat olla jopa 20 cm:n levyisiä. Foraminiferat kuuluvat runsaimpiin ja tieteellisesti tärkeimpiin eliöryhmiin. Äskettäin kuolleiden planktisten foraminiferoiden testit ovat niin runsaita, että ne muodostavat paksun peitteen, joka peittää kolmanneksen maapallon pinnasta (Globigerina-juosteena merenpohjassa). Foraminiferat ovat pääasiassa meressä ja suistoissa eläviä alkueläimiä, jotka elävät kaikissa ympäristöissä suurimmasta syvyydestä aina korkeimpaan tähtitieteelliseen vuorovesitasoon asti ja päiväntasaajalta navoille.

Foraminiferoiden merkitys perustuu niiden fossiilisten testien käyttöön biostratigrafiassa, paleoympäristötutkimuksissa ja isotooppigeokemiassa. Niiden yleisyys useimmissa merellisissä sedimenttikivissä, usein suurina, hyvin säilyneinä ja monimuotoisina kokonaisuuksina, on johtanut siihen, että ne ovat maailmanlaajuisesti eniten tutkittu fossiiliryhmä. Koska viimeaikaiset foraminiferat eivät ole herättäneet juurikaan biologien kiinnostusta, paleontologit ovat joutuneet tekemään suurimman osan tutkimuksista, geneettinen tutkimus mukaan luettuna, elävillä eläimillä.

Tällä sivustolla on seuraavat tavoitteet:

• antaa luettelo maailman foraminiferaalilajeista
• edistää foraminiferaalien nomenklatuurin vakautta
• toimia välineenä korkeampien taksonomisten tarkistusten tekemisessä. ja alueellisten monografioiden

Korkeampi luokittelu

Luettelo nykyisin hyväksytyistä lajeista-ryhmänimet on vähintään 90-prosenttisesti täydellinen viimeaikaisten lajien osalta, mutta monien taksonien taksonomia kaipaa vielä tarkistusta, ja uudet kuvatut lajit lisätään mahdollisimman pian julkaisemisen jälkeen, mihin toimituskunta pyrkii jatkuvasti. Fossiiliset suvut ja korkeammat taksonit ovat suurimmaksi osaksi valmiita, mutta fossiilisten lajien lisääminen vie useita vuosia. Foraminiferoiden korkeammasta luokittelusta ei tällä hetkellä vallitse laajaa yhteisymmärrystä. Tässä yhteydessä käytetään enimmäkseen Loeblichin ja Tappanin (1987 ja 1992) luokittelua kalkkipitoisten taksonien osalta ja Kaminskin (2004) luokittelua agglutinoituneiden taksonien osalta, mutta Foraminiferoiden ylemmän tason luokittelua tarkistetaan parhaillaan, ja se on päivitetty vastaamaan Pawlowskin ym. (2013) ja Holzmannin ja Pawlowskin (2017) tähänastisia geenisekvensseihin perustuvia tuloksia. Käynnissä olevien molekyylifylogeneettisten tutkimusten jatkotulokset auttavat toivottavasti vakiinnuttamaan taksonomista järjestelmää tulevaisuudessa.

• Holzmann, M. ja Pawlowski, J. (2017). Rotaliidien foraminiferoiden päivitetty luokittelu ribosomaalisen DNA:n fylogenian perusteella. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). The Year 2000 Classification of the Agglutinated Foraminifera. In: M. K. Bubik, Ma. (toim.). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Grzybowski Foundation Special Publication. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). ”Foraminiferaalisuvut ja niiden luokittelu”. Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., ja Tappan, H. (1992). Foraminiferaalien luokittelun nykytila. Teoksessa ”Studies in Benthic foraminifera. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990”. (Y. Takayanagi ja T. Saito, toim.), s. 93-102. Tokai University Press, Tokio.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). New supraordinal classification of Foraminifera: Molecules meet morphology. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Steering Committee

Ohjauskomitea

Ohjauskomitea huolehtii kansainvälisestä valvonnasta ja edistää World Foraminifera Database -tietokannan kokoamista ja järkeistämistä.

Ohjauskomitean jäsenet ovat:

• Tomas Cedhagen, Tanska
• Peter Frenzel, Saksa
• Bruce W. Hayward, Uusi-Seelanti (koollekutsuja)
• Martin Langer, Saksa
• François Le Coze, Ranska
• Briony Mamo, Hongkong, Kiina
• Willem Renema, Alankomaat
• Daniel Vachard, Ranska

Toimittajat

Syöttää tietoja ja tekee taksonomisia päätöksiä vastuullaan olevissa ryhmissä:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Vachard, Daniel: Foraminifera

Toimittajat vastaavat merkinnöistä, päätös nimien pätevyydestä. Korjaukset ja puutteet voi osoittaa kummalle tahansa toimittajalle.

Lajin hyväksyminen tietokantaan on toimituksellinen päätös, mutta tunnustamme, että tällaisia päätöksiä on tarkasteltava usein uudelleen uuden tiedon valossa. Jos olet eri mieltä vanhemmista synonymiapäätöksistä tai sukujen määrittelyistä, pyydämme sinua toimittamaan meille hyvin perustellun ja korjatun määrittelyn. Ainoastaan toimittajat voivat lisätä tai muuttaa tietoja, mutta kuka tahansa voi ladata kuvia, joissa on tunnistetiedot ja sijaintitiedot, joskin toimittajat tarkistavat nämä tiedot ja voivat muuttaa niitä

History of the World Foraminifera Database

World Foraminifera Database sai alkunsa Tomas Cedhagenin ja Onno Grossin laatimasta Euroopan tuoreesta lajilistasta. Siihen lisättiin vuonna 2010 Barun Sen Guptan ja kollegoiden kokoama Meksikonlahden viimeaikaisten lajien luettelo ja Bruce Haywardin ja kollegoiden kokoama Uuden-Seelannin nykyaikaisten lajien luettelo.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, in: Costello, M.J. et al. (toim.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera and Xenophyophores. In: Gordon, D.P. (ed.). New Zealand Inventory of biodiversity: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. S. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera of the Gulf of Mexico, Pp. 87-129 teoksessa Felder, D.L. and D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversity. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Sittemmin tietueita on lisätty Johannes Pignatti’s catalogue of recent foraminifera, monista suuremmista viimeaikaisia foraminiferoita käsittelevistä atlasteista sekä Ellis and Messina Catalogue of Foraminifera -julkaisusta. Olemme tietoisia siitä, että monia vuoden 1980 jälkeen kuvattuja taksoneita ei ole vielä löydetty ja lisätty

Kuka kuvasi suurimman määrän viimeaikaisia foraminiferalajeja?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland -. 306

Kirjastokirjasto

Kirjastossa on tällä hetkellä ~9000 viitettä, monet vanhemmista teoksista ovat saatavilla skannattuina PDF-tiedostoina.

Kuvagalleria

Kuvagalleriassa on tällä hetkellä ~6000 kuvaa, jotka on linkitetty lajitietueisiin, enimmäkseen Tomas Cedhagenin syöttämiä kuvia Brady’s Challenger -teoksesta ja Cushmanin monografioista, mutta myös joitain muita monografioita.

Tehtäviä, jotka on vielä suoritettava

Ohjausryhmä on yksilöinyt seuraavat tehtävät, jotka voitaisiin suorittaa Forams in WoRMS -tietokannan hyödyllisyyden ja arvon parantamiseksi. Tehtävät on jaettu johonkin kolmesta prioriteettilistasta. Pyydämme kaikkia työntekijöitä, jotka haluavat tehdä tietokannasta hyödyllisemmän osallistumalla vapaaehtoisesti johonkin alla olevista tehtävistä, ottamaan yhteyttä ohjauskomitean puheenjohtajaan Bruce Haywardiin sähköpostitse.

1. Ohjauskomitean puheenjohtaja Bruce Hayward ja ohjauskomitean puheenjohtaja Bruce Hayward. Ensimmäinen prioriteetti

• Saavutetaan 100-prosenttisesti kaikki virallisesti ehdotetut foraminiferaalien taksonomiset nimet. .
• Lisätään kaikki uudet taksonit sitä mukaa kuin niitä ehdotetaan.
• Päivitetään korkeampi taksonomia sitä mukaa kuin sitä tarkistetaan molekyylitodisteiden perusteella.
• Päivitetään taksonomiaa ja taksonien synonyymejä sitä mukaa kuin uusia molekyylitutkimuksia ja kattavia morfologisia tutkimuksia julkaistaan.
• Saavutetaan 100 %:n kattavuus kaikkien hyväksyttyjen nykyisten taksonien tyyppikuvien tai varmennettujen yksilöiden osalta

2. Määritellään kaikki taksonit. Toinen prioriteetti

• Tarkistetaan kaikki ennen vuotta 2010 tehdyt merkinnät sen varmistamiseksi, etteivät ne enää sisällä virheitä.
• Seurataan linkkejä hyvämaineisiin kuviin/taksonomisiin kuvauksiin, jotka ovat saatavilla institutionaalisilla (pitkäikäisillä) verkkosivustoilla.
• Saavuttaa 100 %:n kattavuus kaikkien hyväksyttyjen fossiilisten taksonien tyyppikuvien tai varmennettujen yksilöiden osalta
• Luokittaa kaikki fossiiliset taksonit vähintään yhteen tai useampaan seuraavista ajanjaksoista: Paleotsooinen, triaskausi, jurakausi, liitukausi, paleogeeni, neogeeni.
• Tarjoa linkki verkkoon tai lataa WoRMS:ään kopio kaikista julkaisuista, joissa kuvataan uusia foraminiferataksoneja.
• Käytä Forams in WoRMS -kirjallisuuslähdetietokantaa (tällä hetkellä 11 000 merkintää) lähtökohtana kehittääksesi kattavan bibliografian maailman foraminifera-julkaisuista.

3. Kolmas prioriteetti

• Anna tunnetut aikavälialueet (tarkemmat kuin ajanjaksot) kaikille fossiilisille taksoneille.
• Saavuttaa maailmanlaajuiset maantieteelliset levinneisyystiedot kaikille elossa oleville lajeille.
• Saavuttaa maailmanlaajuiset maantieteelliset levinneisyystiedot kaikille fossiililajeille.

Linkkejä muille foraminiferaalisivustoille

Aloittelijan tai ei-asiantuntijan avuksi tarjoamme tässä valikoiman linkkejä foraminiferaalien verkkosivuille, joista saa lisätietoa.

• Kuvitettu sanasto foraminiferaalitutkimuksessa käytetyistä termeistä http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Tekniikoita näytteiden valmistamiseen foraminiferaalien tutkimista varten luokkahuoneessa http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Snyder&Huber.html
• Foram Facts http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Foraminiferaaliviitteet http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlases http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-formas http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biography of Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Sitaatit

World Foraminifera Database -tietokannasta saatujen tietojen käyttö tieteellisissä julkaisuissa tulee mainita seuraavin viittauksin:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Accessed at http://www.marinespecies.org/foraminifera on 2021-03-25. doi:10.14284/305

Jos World Foraminifera Database -tietokannan tiedot muodostavat merkittävän osan analyyseissä käytetyistä tietueista, on otettava yhteyttä tietokannan päätoimittajaan tai päätoimittajiin. Sieltä saattaa löytyä lisätietoja, jotka voivat osoittautua arvokkaiksi tällaisissa analyyseissä.
Yksittäiset sivut ovat yksilöllisesti kirjoitettuja ja päivättyjä. Niitä voidaan siteerata erikseen: asianmukainen viittaus on kunkin sivun alareunassa.

Tietoa

World List on hakukelpoinen luettelo lajien ja ylempien taksonien nimistä.

Navigointi tässä luettelossa alkaa klikkaamalla jotakin valikon vaihtoehdoista, joka löytyy jokaisen sivun yläreunasta

• Johdanto johtaa tähän johdanto-osioon
• Etsi taksoneita johtaa kyselysivulle, jonka kautta pääsee kaikille taksonisivuille
• Selaa taksoneita johtaa taksonomiseen puuhun
• Tarkastusluettelo (Checklist) johtaa kyselysivulle, jossa voidaan suoraan valita geounit, jos yksikön täsmällinen nimi on jo tiedossa. Näin tietyn alueen taksoniluettelo löytyy nopeasti.
• Attribuutit johtaa sivulle, jolta voi kysyä (lähinnä) fossiilialueita
• Tilastot joitakin tilastoja World Foraminifera Database -tietokannasta
• Lähteet johtaa kyselysivulle, jolta voi kysyä Foraminifera-kirjallisuuden viitteitä.
• Kuvat johtaa valokuvagalleriaan, jossa on myös kuvia
• Sisäänkirjautuminen vain toimittajien käytettävissä.

Kunkin foraminiferaalilajin tai infraspesifisen taksonin, hyväksytyn tai ei-hyväksytyn, kohdalla voi olla seuraavat merkinnät:

1. sukunimi
2. alasuvun nimi, jos sovellettavissa,
   N.B. ICZN:n mukaan alasuvun nimiä ei tarvitse aina mainita; yhdistelmien hyväksyminen ilman alasuvun nimeä katsotaan ”vaihtoehtoiseksi esitykseksi” tietokannassa.
3. lajin nimi
4. infraspesifinen nimi, tarvittaessa
5. lajin nimen tekijä ja vuosi, ilman sulkuja tai sulkujen kanssa riippuen siitä, onko kyseessä alkuperäinen yhdistelmä vai ei
6. AphiaID (yksilöllinen numeerinen tietokantatunniste)
7. Ylempi luokitus (Loeblichin ja Tappanin (1990, 1992) mukaan)
8. Status ”hyväksytty” tai ”hyväksymätön” (tarvittaessa; Nuorempi synonymia perustuu yleensä julkaistuun tarkistukseen)
9. Tietueen status (osoittaa, kuka on tarkistanut tietueen)
10. Taksonin sijoitus, esim.esim. laji
11. Parent: välittömästi ylempi taksoni, esim. suku, johon nykyinen taksoni kuuluu
12. Synonymisoidut taksonit: luettelo nykyiseen nimeen liitetyistä nuoremmista synonyymeistä
13. Lähteet: kirjallisuusviittaus alkuperäiseen kuvaukseen ja soveltuvin osin hiljattain tehtyyn revisioon (tietueen ”perustana”).
14. Lapsitaksonit: kaikki välittömästi alisteiset taksonit, esim. alalajit
15. Ympäristö: merellinen tai murtovesi
16. Fossiilinen levinneisyysalue: vain viimeaikainen tai tunnetaan myös fossiilisena (pian saatavilla myös aikakausien levinneisyysalueet)
17. Levinneisyys: maininta taksonin viimeaikaisesta maantieteellisestä levinneisyydestä ainakin holotyypin alkuperän perusteella,
    Voidaan ilmoittaa eri maantieteelliset alueet, mieluiten meren ekologinen alue (ks. Spalding et al. 2007), mutta usein myös maan talousvyöhyke. Nuorempien synonyymien levinneisyysalueet näytetään automaattisesti kunkin ”hyväksytyn lajin”
18. Lajiesimerkki: tyyppiesimerkkitiedot tai julkaistujen näytteiden tiedot
19. Linkit: muihin foraminiferaaliresursseihin, kuviin ja muihin tietoihin tietyillä palvelimilla. Nykyiset yleiset linkit ovat:
20. Huomautukset: kaikki asiaankuuluvat lisätiedot, mukaan lukien kuvaukset, kommentit, selitykset jne.
21. Kuvat: sivustolle ladatut valokuvat tai muut kuvat
    Suosimme ”objektiivisia” kuvia taksoneista, kuten valokuvia tai kuvituksia tyyppinäytteistä. Emme suosittele tunnistamattomien foraminiferoiden kuvia, mutta luotettavasti tunnistetut tekijänoikeudettomat kuvat ovat tervetulleita.
22. LSID-merkintä: (samanlainen kuin ISBN julkaisuissa)
23. Muokkaushistoria: merkinnän päivämäärä ja tehdyt muutokset, muokkaajan nimi
24. Linkit taksonomiseen puuhun, Googleen, Google Scholariin ja Google-kuviin.

Ylempien taksonien tietueet ovat yleensä rakenteeltaan samanlaisia kuin lajitietueet. Kaikkia edellä mainittuja kohtia ei vielä ole olemassa kaikkien tietokantaan syötettyjen taksonien osalta, mutta niitä lisätään sitä mukaa, kun aika sallii.

Se, mitä voit tällä hetkellä tehdä tämän tietokannan avulla, on selvittää, mikä on aiheesi foraminiferin tällä hetkellä hyväksytty yhdistelmä, mikä on sen tällä hetkellä hyväksytty ylempään taksoniin kuuluminen ja mistä se on alun perin kuvattu. Voit myös tarkistaa, mitkä hyväksytyt lajit esiintyvät korkeammassa taksonissa. Et voi (vielä) löytää jokaista julkaistua suvun ja lajin nimen yhdistelmää, koska olemme toistaiseksi asettaneet etusijalle alkuperäiset ja tällä hetkellä hyväksytyt yhdistelmät (joten ei-alkuperäiset ei-hyväksytyt yhdistelmät puuttuvat usein vielä). Et myöskään voi kattavasti jäljittää lajien ja ylempien taksonien levinneisyyttä tai poimia alueellisia lajiluetteloita, koska eri puolilta maailmaa syötetyt tiedot eivät vielä ole yhdenmukaisia.