Runoa Flannan Isle siteeraa Tom Baker Tohtorina lopussa Doctor Who -tarinassa Horror of Fang Rock, joka sijoittuu majakalle ja sisältää muukalaisperäisen selityksen tragedialle, joka kohtasi kolmea majakanvartijaa ja haaksirikosta selvinneitä.
Ranskalainen tuottaja Hector Zazou sovitti vuonna 1994 julkaistua Chansons des mers froides (Lauluja kylmistä meristä) -albumia varten otteen Flannan Isle -runosta kappaleeksi nimeltä The Lighthouse. Laulun lauloi Siouxsie Sioux Siouxsie and the Banshees -yhtyeen Siouxsie Siouxsie, ja taustalaulajana toimi naispuolinen Nanai-shamaani.
Genesiksen laulu The Mystery of Flannan Isle Lighthouse (levyllä Archive 1967-75) perustuu tapaukseen, samoin Peter Maxwell Daviesin ooppera The Lighthouse.
Angela J. Elliottin romaani Some Strange Scent of Death on saanut nimensä runon riviltä ja kertoo majakanvartijoiden katoamisesta.
Videopeli Dark Fall II:n päätarina: Lights Out sisältää tapaukseen liittyviä hahmoja ja paikkoja.
2018 skotlantilainen trilleri The Vanishing sijoittuu Flannan-saarille.