Storage of FFPE Tissue

FFPE-näytteitä voidaan säilyttää sairaaloissa, biopankeissa ja tutkimuskeskuksissa. Säilytyslaitokset pitävät usein kirjaa siitä, miten kudos kerättiin, säilytysmenetelmistä ja luovuttajan demografisista tiedoista (kuten, mutta ei ainoastaan: alkuperä, kesto, ikä, etninen alkuperä, sukupuoli ja sairauden vaihe). Demografiset tiedot ovat tärkeä tekijä tutkimuksessa ja kliinisissä tutkimuksissa. Oikein säilötyt FFPE-näytteet ovat erittäin arvokkaita, ja niitä voidaan säilyttää huoneenlämmössä pitkään.

Sovellukset

FPE-näytteet ovat tärkeitä, koska niitä käytetään usein:

a) Immunohistokemiassa

Poistoleikattuja FFPE-näytteitä kiinnitetään objektilaseihin, niitä kylvetään vasta-aineita sisältävässä liuoksessa ja värjätään sen jälkeen värjäyksellä, jotta näytteet näkyisivät paremmin. Tämä menetelmä on tärkeä lääkäreille ja tutkijoille, jotka etsivät kudoksesta patologiaa, kuten Alzheimerin tautia tai syöpää.

b) Onkologia

FFPE-näytteet ovat elintärkeitä onkologian alalla, sillä kasvainkudoksilla on tyypillinen morfologia, jonka avulla tutkijat voivat etsiä tiettyjä proteiineja. Näitä proteiineja käytetään sitten apuna hoidon ja diagnoosin arvioinnissa.

c) Hematologia

Veren ja sen häiriöiden tutkimuksessa FFPE-näytteet ovat tärkeitä poikkeavuuksien määrittämisessä ja parannuskeinojen löytämisessä. Näytteitä voidaan käyttää kudosregeneraatioon, genetiikkaan ja toksikologiaan liittyvissä tutkimuksissa.

d) Immunologia

FFPE-näytteet luovuttajalta, jolla on autoimmuunisairaus, auttavat syyn selvittämisessä ja hoidon kehittämisessä sairauteen.

Komplikaatiot tai rajoitukset

Yksi formaliinia käyttävän fiksaatioprosessin mahdollisista rajoituksista on kudoksessa olevien proteiinien mahdollinen denaturoituminen, jolloin ne eivät ole vasta-aineiden havaittavissa. Tämän ongelman kompensoimiseksi on kehitetty antigeenin talteenottotekniikoita. Antigeenin talteenottotekniikalla saadaan erityisesti talteen DNA, RNA ja proteiinit FFPE-näytteistä. Jotta tämä menetelmä toimisi, FFPE-näytteiden laatu on kriittinen. Ongelmana on myös se, että esianalyyttisessä käsittelyssä, kuten fiksaatiossa ja DNA:n eristämisessä, ei ole käytössä standardimenetelmää. Tämä tarkoittaa, että pienet erot, kuten instrumenttien erilainen käyttö, näytteiden käsittely ja menetelmät, voivat aiheuttaa vaihtelua, joka vaikuttaa DNA:n laatuun ja tutkimustuloksiin. Joitakin tekijöitä, joiden on todettu vaikuttavan FFPE-näytteistä saatuihin tutkimustuloksiin, ovat:

  1. Fiksaatioprotokollan epätarkka kirjaaminen

  2. Fiksaatioajan vaihtelu

  3. Lämpötilan vaihtelu aikana. fiksaatio

  4. FFPE-näytteiden säilytysolosuhteet

Laadunvalvonta

FFPE-näytteiden korkeimman laadun varmistamiseksi, niiden, jotka keräävät ja säilyttävät näitä näytteitä, tulisi:

  1. Toteltava eettisiä ja oikeudellisia normeja.

  2. Pitävät selkeää ja tarkkaa rekisteriä luovuttajista.

  3. Antaa tietoa näytteenotto- ja näytteenottoprosessista

  4. Valvoo näytteiden ottamisen aikana lisensoitua patologia

  5. Hoitaa täydellisen säilytysketjun

  6. Työskentelee ainoastaan huolellisesti valittua jakeluverkostoa, joka toimittaa jatkuvasti korkealaatuisia ja tarkkoja näytteitä

Fresh Frozen Tissue

Fresh Frozen Tissues ovat näytteitä, jotka säilötään nestemäistä typpeä käyttäen niin sanotulla pikapakastusmenetelmällä. Nämä näytteet säilytetään sitten pakastimessa, joka on asetettu alle -80 celsiusasteen lämpötilaan. Tuoreilla pakastekudoksilla on erilaiset käyttökohteet kuin FFPE-näytteillä, sillä niitä voidaan käyttää myös natiivimorfologisiin tutkimuksiin tai molekyylianalyyseihin.

FFPE-näytteet vs. tuoreet pakastekudokset

FFPE:llä ja tuoreilla pakastekudoksilla on hyvät ja huonot puolensa. Ne ovat kaksi erilaista näytetyyppiä, joiden käyttötarkoitukset riippuvat tutkimuksen tai kliinisen tutkimuksen vaatimuksista.

  1. FFPE-lohkot ovat hyvin kovia, ja niitä voidaan helposti säilyttää huoneenlämmössä vuosikymmeniä ilman erikoislaitteita, mikä tekee kudosnäytetyypistä erittäin kustannustehokkaan.

  2. FPE-näytteiden arkisto on tutkijoiden käytettävissä laajasti FFPE-näytteiden säilytykseen liittyvän helppouden vuoksi.

  3. FFPE-näytteitä on käytetty vuosikymmenien ajan, mikä tekee siitä uskomattoman tutun patologeille.

  4. Tuorepakastettu kudos soveltuu paljon paremmin natiivien proteiinien analysointiin, polymeraasiketjureaktioon ja seuraavan sukupolven DNA-sekvensointiin.

  5. Tuorepakastettu kudos takaa DNA:n, RNA:n ja natiivien proteiinien säilymisen.

  6. Tuorepakastetut kudokset vaativat erikoislaitteita säilytykseen. Tämä tarkoittaa, että mekaaniset viat, sähkökatkokset ja huolimattomuus voivat vaikuttaa näytteiden laatuun.

1) Ward T. FFPE-näytteiden asianmukaisen formaliinifiksaation merkitys. Personalis. Luettu 19.6.2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 laadunvalvontasääntöä syöpäkudospankeille. Folio Conversant. Accessed 6/19/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) FFPE vs. pakastetut kudosnäytteet. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Mikä on FFPE-kudos ja mitä käyttötarkoituksia sillä on. BioChain. Accessed 6/19/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/

By: adminPosted on

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.