Der har været stor interesse for at anvende shRNA til genterapi på grund af shRNA’s evne til at give specifik, langvarig gen-stumning. Tre eksempler på shRNA-baserede terapier behandles nedenfor.
Gradalis, Inc. har udviklet FANG-vaccinen, som anvendes til behandling af fremskredne kræftformer. FANG er baseret på et bifunktionelt shRNA (bi-shRNA) mod de immunosuppressive transformerende vækstfaktorer (TGF) β1 og β2. Autologe tumorceller blev høstet fra patienter, og et plasmid, der kodede for det bifunktionelle shRNA og granulocyt-macrophage colony-stimulating factor (GMCSF), blev indført ex vivo ved elektroporation. Disse celler blev senere bestrålet og injiceret tilbage til patienten.
Marina Biotech har udviklet CEQ508, som anvendes til behandling af familiær adenomatøs polyposis. CEQ508 anvender en bakterievektor til at levere shRNA mod β-catenin.
Gradalis, Inc. har udviklet bifunktionelt shRNA-STMN1 (pbi-shRNA STMN1), som anvendes til behandling af avancerede og/eller metastaserende kræftformer. Dette pbi-shRNA STMN1 er mod stathmin 1 og leveres intratumoralt gennem bilamellar invagineret vesikel (BIV) lipoplex (LP)-teknologi.
Der er flere udfordringer, som shRNA-baserede terapeutika typisk står over for. Den største udfordring er levering. shRNA leveres typisk ved hjælp af en vektor, og selv om de generelt er effektive, giver de anledning til betydelige sikkerhedsproblemer. Især har viralbaserede genterapimetoder vist sig at være farlige i tidligere kliniske forsøg. I den første generation af retroviral genterapi udviklede nogle patienter, der blev behandlet med virale vektorer mod Wiskott-Aldrich-syndromet, akut T-celle-leukæmi. Det blev fastslået, at dette var forårsaget af placeringen af den virale vektorindsættelse. En potentiel overmætning af RISC er også et problem. Hvis shRNA’et udtrykkes i for høje niveauer, kan cellen muligvis ikke være i stand til at behandle det endogene RNA korrekt, hvilket kan medføre betydelige problemer. En anden udfordring er muligheden for, at patienten kan udvikle et immunforsvar mod behandlingen. Endelig kan der opstå off-target-effekter, og shRNA’et kan lukke munden på andre gener, der ikke er tiltænkt. Ved udviklingen af nye shRNA-baserede terapier med succes skal der tages hensyn til alle disse udfordringer.