RevcoEdit
Med en ny partner, Bernard Marden, og ved at udnytte de færdigheder, han havde opnået som grossist, dannede han et firma ved navn Odd Lot Trading, en grossist og forhandler af udgåede varer. I maj 1984 solgte de Odd Lot til Revco Discount Drug Stores i bytte for 12% af Revco-aktierne. Han udfordrede snart Revcos ledelse for at få kontrol over virksomheden, men efter indledende positive tilbagemeldinger blev han afvist. Perlmutter og hans partner truede med en fjendtlig overtagelse, men undlod til sidst at gøre det og solgte deres andel tilbage til Revco for 120 mio. dollars.
ColecoEdit
Perlmutter havde et tæt forhold til ledelsen i legetøjsproducenten Coleco Entertainment Corporation, da han i nogen tid havde købt usolgte lagre fra dem. Som det er typisk i branchen, var betalingsbetingelserne ofte usædvanlige. Hos Coleco købte Perlmutter usolgte lagervarer til gengæld for 50 % kontanter og 50 % i “barter-reklamekreditter” (i princippet et løfte om at betale for Colecos fremtidige reklameudgifter). I løbet af en fireårig periode havde Perlmutter modtaget varer til en værdi af 144 millioner dollars og betalt 73 millioner dollars i kontanter og samtidig givet 71 millioner dollars i reklame-kreditter, som skulle betales i fremtiden.
I 1988 så han en mulighed, da Coleco kæmpede med sin gæld på grund af fremkomsten af den personlige computer, som påvirkede salget af videospil. Perlmutter købte al Colecos førsteklasses gæld (med en nominel værdi på 85 mio. dollars) for 50 mio. dollars, hvilket var en betydelig rabat, og han blev dermed efterstillet deres obligationsindehavere i tilfælde af en konkurs. Selv om Perlmutter mente, at det var sandsynligt, at Coleco ville gå konkurs, mente han også, at værdien af Colecos aktiver burde være tilstrækkelig til at dække hele den værdi på 85 millioner dollars, som han havde købt. I juli 1988 indgav Coleco en konkursbegæring i henhold til kapitel 11. Obligationsejerne, der var mistænksomme over Perlmutters tætte forbindelser med Colecos ledelse, sagsøgte Perlmutter med påstand om svigagtig overdragelse af reklamekreditterne (som udgjorde en meget vigtig post på Colecos balance). Efter omfattende forhandlinger blev der indgået et forlig, hvorefter Coleco blev solgt til Hasbro Corporation for 85 mio. dollars, og Perlmutter accepterede 64 mio. dollars for sit krav på nu 90 mio. dollars (hovedstol plus renter) til gengæld for tilbagetrækning af søgsmålet.
RemingtonEdit
I 1994 solgte Victor Kiam sin kontrollerende aktiepost i Remington Products til Isaac Perlmutter. Perlmutter blev vicepræsident for Remington. Kiam og Perlmutter solgte Remington til Vestar Capital Partners i 1996.
MarvelEdit
Isaac Perlmutter var medlem af bestyrelsen for Marvel Comics fra april 1993 og var formand for bestyrelsen indtil marts 1995.
Isaac Perlmutter var også medejer sammen med Avi Arad af Toy Biz (senere Marvel Toys), efter at have købt forgængervirksomheden fra Charan Industries i januar 1990. Toy Biz, Inc. blev reorganiseret i forbindelse med Marvel-aftalen, idet Perlmutter fortsat ejede det oprindelige Toy Biz, Inc. som blev omdøbt til Zib, Inc. Zib ejede sit udenlandske salgsselskab, Toy Biz International Ltd., et selskab i Hongkong og Perlmutters andel af det nye Toy Biz, Inc.
Da Marvel Group gik konkurs i 1996, fulgte langvarige juridiske kampe om kontrollen med selskabet mellem Perlmutter, Arad, Carl Icahn og Ronald Perelman. I 1997 havde Perlmutter og Arad etableret kontrol over selskabet og skubbede Icahn og Perelman ud. ToyBiz og Marvel blev fusioneret til Marvel Enterprises for at bringe det ud af konkursen i juni 1998, hvor ToyBiz blev en afdeling af det nye selskab.
Den 30. november 2001 blev Perlmutter næstformand for Marvel. Han blev administrerende direktør for Marvel Comics den 1. januar 2005. Han forblev administrerende direktør for Marvel Entertainment, selv efter at Marvel blev overtaget af The Walt Disney Company den 31. december 2009. Selv om Perlmutter modtog 800 millioner dollars i kontanter og 590 millioner dollars i Disney-aktier efter overtagelsen, ønskede han ikke en plads i Disneys bestyrelse.
I september 2015 stoppede Perlmutter med at føre tilsyn med udviklingen af Marvel Studios. Disney mente, at studiets leder, Kevin Feige, skulle rapportere direkte til formanden for The Walt Disney Studios, Alan Horn, så alle filmiske ejendomme i Disney, herunder Pixar og Lucasfilm, var under én ledelsesstruktur. Omstruktureringen skyldtes angiveligt Feiges “frustration” over at arbejde sammen med Perlmutter samt nogle påståede kontroversielle kommentarer og handlinger fra Perlmutters side, såsom at erstatte besætningen af Terrence Howard som James Rhodes med Don Cheadle, fordi sorte mennesker “ser ens ud”. En person med kendskab til hans kreative tilgang sagde: “Ike Perlmutter hverken diskriminerer eller bekymrer sig om mangfoldighed, han bekymrer sig bare om, hvad han tror vil tjene penge.” Jeph Loeb, der har tilsyn med Marvel Television og tv-egenskaberne i Marvel Cinematic Universe, rapporterede stadig til Perlmutter frem til 2019.