Foraminifera – The World Foraminifera Database

Nuværende antal gyldige nyere arter registreret: 8 887
Gældende antal gyldige fossile arter registreret: 40 130
Gældende antal samlede gyldige (fossile + nyere) arter registreret: 48 271

The World Foraminifera Database

Denne verdensdatabase over alle arter af Foraminifera, der nogensinde er beskrevet (nyere og fossile), er en del af World Register of Marine Species (WoRMS), et globalt initiativ, der har til formål at oprette et register over alle marine organismer.

Søgning i databasen (fossile og/eller nyere)

Standardindstillingen er at søge i hele databasen med fossile og nyere arter. Hvis du kun vil søge i de nyere (levende) taxaer, skal du afkrydse feltet ‘extant’ i vinduet Taxon Search.

Hvad er Foraminifera?

Foraminifera (‘hulbærere’), foraminiferer eller forams forkortet, er en stor stamme af amøboide protozoer (encellede) med netformede pseudopoder, fine tråde af cytoplasma, der forgrener sig og smelter sammen til et dynamisk net. De producerer normalt en test (eller skal), som kan have et eller flere kamre, og som er lavet af calciumcarbonat (CaCO3) eller mineralkorn eller andre partikler, der er limet sammen. Testene er normalt mindre end 0,5 mm i størrelse, men de største kan være op til 20 cm i diameter. Foraminiferer er blandt de mest hyppige og videnskabeligt vigtige grupper af organismer. Prøverne fra nyligt døde planktoniske foraminiferer er så talrige, at de danner et tykt tæppe over en tredjedel af jordens overflade (som Globigerina ooze på havbunden). Foraminiferer er hovedsagelig marine og flodmundingslevende protozoer, der lever i alle miljøer fra de største dybder og op til det højeste astronomiske tidevandsniveau og fra ækvator til polerne.

Foraminiferer har stor betydning, fordi deres fossile test anvendes til biostratigrafi, palæomiljøundersøgelser og isotopgeokemi. Deres allestedsnærværelse i de fleste marine sedimentære bjergarter, ofte som store, velbevarede, forskelligartede samlinger, har resulteret i, at de er den mest studerede gruppe af fossiler på verdensplan. Da nyere foraminiferer kun har tiltrukket sig lidt interesse fra biologer, har palæontologer været tvunget til at foretage de fleste undersøgelser, herunder genetisk forskning, på den levende fauna.

Dette websted har følgende formål:

• at tilvejebringe et katalog over verdens arter af foraminiferer
• at fremme stabiliteten i nomenklaturen for foraminiferer
• at fungere som et redskab for højere taxonomiske revisioner og regionale monografier

Højere klassifikation

Listen over de i øjeblikket accepterede arts-gruppebetegnelser er mindst 90 % komplet for nyere arter, men taxonomien for mange taxa skal stadig revideres, og nyligt beskrevne arter vil blive tilføjet så hurtigt som muligt efter offentliggørelsen, en opgave, som redaktørerne løbende vil påtage sig. Fossile slægter og højere taxa er for det meste komplette, men det vil tage mange år at tilføje fossile arter. Der findes i øjeblikket ikke nogen bred konsensus om den højere klassifikation af Foraminifera. Her anvendes klassifikationen i Loeblich og Tappan (1987 og 1992) mest for kalkholdige taxa og Kaminski (2004) følges for agglutinerede taxa, men klassifikationen af Foraminifera på højere niveau er under revision og er blevet opdateret for at overholde de hidtidige genetiske sekvensbaserede resultater af Pawlowski et al. (2013) og Holzmann og Pawlowski (2017). Yderligere resultater af igangværende molekylærfylogenetiske undersøgelser vil forhåbentlig bidrage til at stabilisere det taksonomiske system i fremtiden.

• Holzmann, M. og Pawlowski, J. (2017). En opdateret klassifikation af rotaliide foraminifera baseret på ribosomal DNA-fylogeni. Marine Micropaleontology 132, 18-34.
• Kaminski, M. A. (2004). År 2000-klassificering af de sammenklistrede foraminifera. In: M. K. Bubik, Ma. (red). Proceedings of the Sixth International Workshop on Agglutinated Foraminifera. Grzybowski Foundation Special Publication. Pp. 237-255.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1987). “Foraminiferal genera and their classification.” Van Nostrand Reinhold, New York.
• Loeblich, A. R., and Tappan, H. (1992). Nuværende status for klassifikation af foraminiferer. I “Studies in Benthic foraminifera. Proceedings of the Fourth Symposium on benthic foraminifera, Sendai, 1990.” (Y. Takayanagi, og T. Saito, Eds.), pp. 93-102. Tokai University Press, Tokyo.
• Pawlowski, J., Holzmann, M., Tyszka, J. (2013). Ny supraordinal klassifikation af Foraminifera: Molekyler møder morfologi. Marine Micropaleontology 100, 1-10

Styrekomité

En styregruppe sørger for internationalt tilsyn og fremmer udarbejdelsen og rationaliseringen af World Foraminifera Database.

Styrekomitéens medlemmer er:

• Tomas Cedhagen, Danmark
• Peter Frenzel, Tyskland
• Bruce W. Hayward, New Zealand (indkalder)
• Martin Langer, Tyskland
• François Le Coze, Frankrig
• Briony Mamo, Hong Kong, Kina
• Willem Renema, Nederlandene
• Daniel Vachard, Frankrig

Redaktører

Indfører data og træffer taksonomiske beslutninger i de grupper, de har ansvaret for:

• Hayward, Bruce: Foraminifera

• Encarnação, Sarita Camacho da: Foraminifera
• Le Coze, François: Foraminifera
• Mamo, Briony: Foraminifera
• Vachard, Daniel: Foraminifera

Redaktørerne er ansvarlige for indtastninger, beslutning om navnenes gyldighed. Rettelser og udeladelser kan rettes til en af redaktørerne.

Accept af en art i databasen er en redaktionel beslutning, men vi erkender, at sådanne beslutninger ofte skal tages op til fornyet overvejelse i lyset af nye oplysninger. Hvis du er uenig i ledende synonymiseringsbeslutninger eller slægtstildelinger, bedes du give os din velargumenterede-korrigerede tildeling til kende. Kun redaktørerne kan tilføje eller ændre data, men alle kan uploade billeder med identifikationer og lokalitetsoplysninger, selv om dette vil blive kontrolleret og kan ændres af redaktørerne

Historie for World Foraminifera Database

World Foraminifera Database startede som den europæiske nyere artsliste, der blev udarbejdet af Tomas Cedhagen og Onno Gross. I 2010 blev den suppleret med listen over nyere arter i Den Mexicanske Golf, udarbejdet af Barun Sen Gupta og kolleger, og listen over moderne arter i New Zealand, udarbejdet af Bruce Hayward og kolleger.

• Gross, O. (2001). Foraminifera, i: Foraminifera: Costello, M.J. et al. (Ed.) (2001). European register of marine species: a check-list of the marine species in Europe and a bibliography of guides to their identification. Collection Patrimoines Naturels, 50: 60-75.
• Hayward, B.W., Tendal, O.S., Carter, R., Grenfell, H.R., Morgans, H.E.G., Scott, G.H., Strong, C.P., Hayward, J.J. (2012). Phylum Foraminifera. Foraminifera og Xenophyophores. In: Gordon, D.P. (red.). New Zealand Inventory of biodiversity: A Species 2000 Symposium Review. Canterbury University Press,. Christchurch. Pp. 242-287
• Sen Gupta, B.K., Smith, L.E., Machain-Castillo, M.L. (2009). Foraminifera of the Gulf of Mexico, Pp. 87-129 i Felder, D.L. og D.K. Camp (eds.), Gulf of Mexico-Origins, Waters, and Biota. Biodiversity. Texas A&M Press, College Station, Texas.

Siden da er der blevet tilføjet registreringer fra Johannes Pignattis katalog over nyere foraminiferer, mange større atlas over nyere foraminiferer og output fra Ellis and Messina Catalogue of Foraminifera. Vi er klar over, at mange taxa, der er beskrevet siden 1980, endnu ikke er fundet og tilføjet

Hvem har beskrevet det største antal nyere Foraminiferal-arter?

• McCulloch – 2429
• Cushman – 1134
• D’Orbigny – 691
• Brady – 398
• Saidova – 394
• Earland – 394
• 306

Litteraturbibliotek

Litteraturbiblioteket indeholder i øjeblikket ~9000 referencer, mange af de ældre værker er tilgængelige som scannede PDF-filer.

Fotogalleri

Fotogalleriet indeholder i øjeblikket ~6000 billeder knyttet til artsregistreringer, for det meste indtastet af Tomas Cedhagen fra Bradys Challenger-bånd og Cushman-monografier, men også nogle andre monografier.

Tasks to be done

Styregruppen har identificeret følgende opgaver, som kan udføres for at forbedre anvendeligheden og værdien af Forams in WoRMS-databasen. Opgaverne er blevet fordelt på en af tre opfattede prioritetslister. Vi opfordrer enhver medarbejder, der ønsker at gøre denne database mere nyttig ved at bidrage til en af nedenstående opgaver på frivillig basis, til at kontakte formanden for styregruppen, Bruce Hayward, pr. e-mail.

1. Første prioritet

• At opnå 100 % indtastning af alle formelt foreslåede taksonomiske navne på foraminiferer. .
• Indføj alle nye taxa, efterhånden som de bliver foreslået.
• Ajourfør højere taxonomi, efterhånden som den revideres på grundlag af molekylære beviser.
• Ajourføre taxonomi og synonymier for taxaer, efterhånden som der offentliggøres nye molekylære og omfattende morfologiske undersøgelser.
• Opnå 100 % dækning for billeder af typer eller verificerede eksemplarer af alle accepterede eksisterende taxa

2. Anden prioritet

• Kontroller alle poster fra før 2010 for at sikre, at de ikke længere indeholder fejl.
• Opnå links til velrenommerede billeder/taksonomiske beskrivelser, der er tilgængelige på institutionelle (langlivede) websteder.
• Opnå 100 % dækning for billeder af typer eller verificerede eksemplarer af alle accepterede fossile taxa
• Tilknyt alle fossile taxa til mindst en eller flere af følgende tidsperioder: Palæozoikum, Trias, Jura, Kridt, Palæogen, Neogen.
• Giv et link på nettet eller indlæs på WoRMS en kopi af alle publikationer, der beskriver nye foraminifera-taxaer.
• Brug databasen Forams in WoRMS literature sources database (i øjeblikket 11.000 poster) som udgangspunkt for at udvikle en omfattende bibliografi over verdens publikationer om foraminifera.

3. Tredje prioritet

• Giv kendte tidsintervaller (mere præcise end perioder) til alle fossile taxa.
• Af opnå globale geografiske udbredelsesdata for alle eksisterende arter.
• Af opnå global geografisk udbredelsesdækning for alle fossile arter.

Link til andre Foriminiferal-websteder

For at hjælpe nybegynderen eller ikke-specialisten giver vi her et udvalg af links til foraminiferal-websteder for yderligere oplysninger.

• Illustreret ordliste over termer, der anvendes i foraminiferalforskning http://paleopolis.rediris.es/cg/CG2006_M02/index.html
• Teknikker til forberedelse af prøver til undersøgelse af foraminiferer i klasseværelset
• Foram Fakta http://www.ucmp.berkeley.edu/fosrec/Wetmore.html
• Wikipedia http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
• Foraminiferal referencer http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/foramrefs.htm
• Cushman Foundation for Foraminiferal Research http://www.cushmanfoundation.org/
• Grzybowski Foundation http://www.es.ucl.ac.uk/Grzybowski/
• The Micropalaeontological Society http://www.tmsoc.org/
• University of California Museum of Paleontology – Introduction to foraminifera http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• University College, London – Foraminifera http://www.ucl.ac.uk/GeolSci/micropal/foram.html
• Chronos foram on-line atlas http://portal.chronos.org/gridsphere/gridsphere?cid=resources
• The Foraminifera.eu Project http://www.foraminifera.eu/
• E-former http://www.eforams.org
• Molecular Database of Foraminifera http://forambarcoding.unige.ch/
• Biografi om Joseph Cushman http://paleobiology.si.edu/cushman

Citation

Anvendelse af data fra World Foraminifera Database i videnskabelige publikationer bør anerkendes ved at citere på følgende måde:

• Hayward, B.W.; Le Coze, F.; Vachard, D.; Gross, O. (2021). World Foraminifera Database. Tilgået http://www.marinespecies.org/foraminifera den 2021-03-25. doi:10.14284/305

Hvis data fra World Foraminifera Database udgør en væsentlig del af de registreringer, der anvendes i analyser, bør databasens chefredaktør(er) kontaktes. Der kan være yderligere data, som kan vise sig værdifulde for sådanne analyser.
De enkelte sider er individuelt forfattet og dateret. De kan citeres separat: den korrekte kildeangivelse er angivet nederst på hver side.

Om

Verdenslisten er et søgbart katalog over navne på arter og højere taxaer.

Navigation i dette katalog starter med at klikke på et af valgmulighederne i menuen, som du finder øverst på hver side

• Introduktion vil føre dig til dette indledende afsnit
• Søg taxa vil føre til en forespørgselsside, hvorigennem alle taxasider kan tilgås
• Gennemse taxa vil føre til et taksonomisk træ
• Tjekliste vil føre til en forespørgselsside, hvor en geounit kan vælges direkte, hvis det nøjagtige navn på enheden allerede er kendt. På denne måde kan man hurtigt finde en liste over taxaer for et givet område.
• Attributter vil føre til en side til forespørgsel efter (hovedsageligt) fossilområder
• Stats nogle statistikker om World Foraminifera Database
• Kilder vil føre til en forespørgselsside for referencer af Foraminifera-litteratur.
• Billeder vil føre til et fotogalleri med billeder
• Login kun tilgængeligt for redaktører.

For hver foraminiferal art eller infraspecifikt taxon, accepteret eller ej, kan der være følgende angivelser:

1. genusnavn
2. undergenusnavnet, hvis det er relevant,
   N.B. Undergenusnavne behøver ikke altid at blive citeret i henhold til ICZN; accept af kombinationer uden undergenusnavne betragtes som “alternativ repræsentation” i databasen.
3. artnavnet
4. det infraspecifikke navn, hvis det er relevant
5. forfatter og årstal for artsnavnet, uden eller med parentes, afhængigt af, om det er den oprindelige kombination eller ej
6. AphiaID (en unik numerisk databaseidentifikator)
7. den højere klassifikation (i henhold til Loeblich og Tappan, 1990, 1992)
8. status som “accepteret” eller “ikke accepteret” (hvis relevant; juniorsynonymi er normalt baseret på publiceret revision)
9. Registreringsstatus (angiver, hvem der har kontrolleret registreringen)
10. Taxonets rang, f.eks.f.eks. art
11. Parent: umiddelbart højere taxon, f.eks. slægt, som det aktuelle taxon tilhører
12. Synonymiserede taxa: listen over yngre synonymer knyttet til det aktuelle navn
13. Kilder: litteraturhenvisning til den oprindelige beskrivelse og eventuelt til en nyere revision (som “grundlaget for registreringen”).
14. Child taxa: alle umiddelbart underordnede taxa, f.eks. underarter
15. Miljø: marint eller brakvand
16. Fossilt udbredelsesområde: kun nyere eller også kendt som fossil (snart vil epokområder være tilgængelige)
17. Udbredelsesområde: angivelse af den seneste geografiske udbredelse af taxonet, i det mindste baseret på holotypens oprindelse,
    Der kan angives forskellige geografiske områder, fortrinsvis den marine økoregion (se Spalding et al. 2007), men ofte også landets eksklusive økonomiske zone. Udbredelsesområderne for de yngre synonymer vises automatisk med hver “accepteret art”
18. Specimen: oplysninger om typeeksemplar eller offentliggjorte oplysninger om eksemplar
19. Links: til andre foraminifereressourcer, til billeder og andre oplysninger på specifikke servere. De nuværende generelle links er: Genbank osv.
20. Notes: yderligere relevante oplysninger, herunder beskrivelser, kommentarer, forklaringer osv.
21. Billeder: fotos eller andre billeder, der er uploadet til webstedet
    Vi foretrækker “objektive” billeder af taxaerne, f.eks. fotos eller illustrationer af typeeksemplarer. Vi tilskynder ikke til fotos af uidentificerede foraminifera, men pålideligt identificerede ophavsretsfrie billeder er velkomne.
22. LSID notation: (svarer til ISBN i publikationer)
23. Redigeringshistorik: dato for indtastning og foretagne ændringer, navn på redaktør
24. Link til et taksonomisk træ, Google, Google Scholar og Google images.

Registreringerne om højere taxa har generelt samme struktur som registreringer af arter. Ikke alle ovennævnte punkter findes allerede for alle de taxa, der er indtastet i databasen, men de vil blive tilføjet, efterhånden som tiden tillader det.

Det, du kan gøre med denne database på nuværende tidspunkt, er at finde ud af, hvad den aktuelt accepterede kombination er af dit emneforaminifer, hvad dets aktuelt accepterede højere taxontilhørsforhold er, og hvorfra det oprindeligt blev beskrevet. Du kan også kontrollere, hvilke accepterede arter der forekommer i et højere taxon. Hvad du (endnu) ikke kan gøre, er at finde alle offentliggjorte kombinationer af slægts- og artsnavne, da vi indtil videre har prioriteret de oprindelige og de aktuelt accepterede kombinationer (så ikke-originale ikke-accepterede kombinationer mangler ofte stadig). Hvad man heller ikke kan gøre på en omfattende måde er at spore udbredelsen af arter og højere taxa eller udtrække regionale lister over arter, da der endnu ikke er nogen konsistens i de indtastede data fra hele verden.