É realizada predominantemente agora como técnica terapêutica. Existem meios menos invasivos de imagem da árvore biliar, incluindo ultra-som transabdominal, colangiopancreatografia por ressonância magnética, tomografia computadorizada e ultra-som endoscópico. Se o sistema biliar estiver obstruído, o PTC pode ser usado para realizar a drenagem biliar até que uma solução mais permanente para a obstrução seja realizada (por exemplo, cirurgia). Além disso, podem ser colocadas endopróteses metálicas auto-expansíveis através de estrangulamentos biliares malignos para permitir a drenagem paliativa. A colocação percutânea de stents metálicos pode ser utilizada quando a CPRE terapêutica não tiver sido bem sucedida, a anatomia for alterada impedindo o acesso endoscópico ao duodeno, ou quando tiver havido separação da drenagem biliar segmentar do fígado, permitindo a colocação mais seletiva de stents metálicos.
A colangiografia durante uma intervenção de drenagem biliar é chamada de perioperatório ou colangiografia primária, e quando realizada posteriormente no mesmo dreno é chamada de colangiografia secundária.