Vaqueros de Dallas (1989-2000)Edit
Aikman fue la primera elección global en el Draft de la NFL de 1989, por los Vaqueros de Dallas. El 25 de febrero de 1989, el nuevo propietario Jerry Jones despidió a Tom Landry y lo sustituyó por Jimmy Johnson. Unos meses más tarde, en el draft suplementario de la NFL, Johnson reclutó a Steve Walsh, quien jugó para Johnson en la Universidad de Miami. Aikman ganó el puesto de mariscal de campo titular, y Walsh fue cambiado a principios de la temporada de 1990.
Aikman jugó su primer partido de pretemporada de la NFL el 26 de agosto de 1989, contra los Broncos de Denver. Su debut en la NFL comenzó con una derrota por 28-0 ante los New Orleans Saints. A la semana siguiente, Aikman lanzó su primer pase de touchdown, una finalización de 65 yardas a Michael Irvin, pero los Atlanta Falcons interceptaron dos pases y ganaron. En un partido contra los Arizona Cardinals, lanzó para 379 yardas y estableció un récord de novato en la NFL. Aikman terminó 1989 con un récord de 0-11 como titular, completando 155 de 293 pases para 1.749 yardas, 9 touchdowns y 18 intercepciones.
Después de la temporada de novato de Aikman, Dallas seleccionó al corredor de los Gators de Florida Emmitt Smith en la primera ronda del Draft de la NFL de 1990. Con Smith e Irvin, Aikman llevó a los Cowboys a un récord de 7-7 en la temporada de 1990, pero se lesionó en el 15º partido, contra los Philadelphia Eagles. Los Cowboys perderían ese partido y la semana siguiente contra los Atlanta Falcons con el mariscal de campo suplente Babe Laufenberg, perdiendo el último puesto de comodín para los playoffs por un partido.
En 1991, Aikman llevó a los Cowboys a un récord de 6-4 en los primeros 10 partidos y tenía a los Cowboys por delante en la semana 12 contra los invictos Washington Redskins cuando se lesionó. Steve Beuerlein sustituyó a Aikman, y Dallas terminó la temporada con 5-0 y obtuvo el puesto número 5 en los playoffs. Beuerlein llevó a los Cowboys a una victoria en la carretera sobre los Chicago Bears, número 4, en la ronda de comodines. La semana siguiente, con los Cowboys perdiendo por 17-6 en el descanso contra los Detroit Lions en el partido de los playoffs divisionales de la NFC, Aikman fue introducido para comenzar el tercer cuarto, pero no pudo proporcionar una chispa y los Cowboys perdieron por 38-6. Aikman fue seleccionado para el primero de los seis Pro Bowls consecutivos.
En 1992, Aikman estableció los máximos de su carrera en cuanto a pases completados (302), yardas de pase (3.445) y pases de touchdown (23), y llevó a los Cowboys a un récord de equipo de 13 victorias en la temporada regular y el segundo mejor récord de la NFC. Durante los playoffs, Aikman rompió el récord de Joe Montana de 83 pases sin intercepción al lanzar 89. Los Cowboys derrotaron a los Eagles en casa en los Playoffs Divisionales y se enfrentaron a los 49ers en el Campeonato de la NFC, un duelo que enfrentaba a los dos mejores equipos de la NFC. Los Cowboys ganaron, 30-20, con Aikman completando dos pases que cambiaron el juego para enviar a los Cowboys a su primera aparición en el Super Bowl desde 1979. En la Super Bowl XXVII contra los Buffalo Bills, Aikman llevó a los Cowboys a una victoria por 52-17 (casualmente el partido se jugó en el estadio de su alma mater, el Rose Bowl). Aikman fue nombrado MVP de la Super Bowl tras completar 22 de 30 pases para 273 yardas y 4 touchdowns.
En 1993, Dallas terminó 12-4, el mejor récord de la NFC. En los playoffs, Aikman volvió a guiar a Dallas a la victoria en los playoffs en casa, esta vez sobre un joven y prometedor equipo de los Green Bay Packers liderado por el quarterback Brett Favre, que estaba en su primera temporada completa como quarterback titular. Aikman destrozó a la secundaria de los 49ers en el Campeonato de la NFC por 38-21, antes de abandonar el partido con una conmoción cerebral después de que la rodilla del tackle defensivo de los 49ers, Dana Stubblefield, golpeara la cabeza de Aikman. Aikman dice ahora que no recuerda haber jugado ese partido. En el Super Bowl XXVIII, Aikman no pudo llegar a la zona de anotación, pero una combinación de pérdidas de balón clave por parte de la ofensiva de los Bills y las carreras de Emmitt Smith ayudaron a la victoria de los Cowboys por 30-13.
El entrenador principal Jimmy Johnson dejó el equipo el 29 de marzo de 1994, y Jerry Jones contrató a Barry Switzer, el antiguo entrenador universitario de Aikman en Oklahoma. Los Cowboys terminaron con el segundo mejor récord de la NFC, (detrás de los 49ers) y Aikman volvió a perder tiempo de juego debido a las lesiones. Dallas ganó su partido de desempate divisional contra Green Bay 35-9, pero cayó ante los 49ers en el campeonato de la NFC, 38-28.
En 1995, Aikman pasó para más de 3.300 yardas y los Cowboys volvieron a terminar con el mejor récord de la NFC, con los 49ers teniendo el segundo mejor récord. Aikman quedó fuera de una esperada revancha entre Dallas y San Francisco cuando Stubblefield, de los 49ers, cayó sobre Aikman, forzando su rodilla a golpear el césped. Tras la derrota de los 49ers en casa ante los Packers, los Cowboys recibieron a los Packers en el Campeonato de la NFC y, por tercera temporada consecutiva, eliminaron a los Packers de los playoffs, esta vez por 38-27, para conseguir su tercera aparición en la Super Bowl en cuatro años. Dallas ganó el Super Bowl XXX contra los Pittsburgh Steelers por 27-17, con Aikman lanzando un pase de touchdown.
En 1996, a pesar de los problemas ofensivos, Aikman volvió a ayudar a guiar a Dallas a otro título de la División Este de la NFC y a un partido en casa para la ronda de playoffs de Wild Card, una paliza de 40-15 a los Minnesota Vikings. En 1997, Aikman se convirtió en el primer mariscal de campo en la historia de los Cowboys en tener tres temporadas consecutivas de 3.000 yardas, pero el equipo terminó 6-10 y se perdió los playoffs por primera vez desde 1990. Switzer sufrió la primera temporada perdedora de su carrera, y renunció al final de la temporada.
1998 fue un año de rebote para Aikman y los Cowboys, y a pesar de perderse cinco partidos, Aikman volvió a ayudar a llevar a Dallas al título de la NFC Este y a los playoffs. Dallas fue sorprendido en casa en el juego de Comodines, ya que los Cardenales de Arizona, número 6, ganaron por 20-7.
La temporada de 1999 comenzó con una explosión para Aikman y los Cowboys cuando se enfrentaron a los Redskins. Aikman lanzó cinco pases de touchdown, incluyendo el ganador del partido en la prórroga para vencer a Washington. 1999 también marcó la última aparición de Aikman en los playoffs, y la última temporada en la que el trío formado por Aikman, Irvin y Emmitt Smith jugaría junto. Dallas terminó 8-8 y perdió en el juego de playoffs de Wild Card en Minnesota, 27-10.
La temporada 2000 fue la última de Aikman como jugador de fútbol americano profesional. Aikman sufrió varias conmociones cerebrales durante la temporada, y se produjo una puerta giratoria en el puesto de mariscal de campo entre Aikman y el ex mariscal de campo de los Eagles, Randall Cunningham. El último partido de Aikman fue en casa contra los Washington Redskins. Fue golpeado por el linebacker LaVar Arrington y sufrió la décima y última conmoción cerebral de su carrera.
Durante la temporada baja de 2001, Aikman fue renunciado un día antes de que le correspondiera una extensión de contrato de 70 millones de dólares/7 años, y finalmente anunció su retiro el 9 de abril, después de no encontrar otro equipo. Terminó su carrera como el máximo pasador de los Cowboys de todos los tiempos (32.942 yardas). 90 de las 94 victorias de su carrera se produjeron en la década de 1990 y fueron la mayor cantidad de un mariscal de campo en cualquier década hasta que Peyton Manning lo superó en la década de 2000 con 115 victorias. Actualmente, Aikman es el tercero en esa lista, también por detrás de Tom Brady (122 en la década de 2010).
Durante una entrevista radiofónica a finales de diciembre de 2013, Aikman dijo que la verdadera razón por la que se retiró fue por los persistentes problemas de espalda que tuvo en su última temporada. Aikman explicó que se operó de la espalda en la temporada baja después de la Super Bowl XXVII sin complicaciones, pero que al llegar a su última temporada estaba recibiendo constantemente tratamiento para el dolor de espalda. Aunque el golpe de Arrington acabó con su temporada 2000, él afirma que fue el dolor de espalda y no esa conmoción cerebral lo que acabó con su carrera. En una entrevista de enero de 2020, Aikman dijo que quería firmar con los San Diego Chargers después de haber sido liberado por los Cowboys en la temporada baja de 2001 para jugar con Norv Turner, pero en su lugar ficharon a Doug Flutie y Aikman optó por retirarse. Dijo que Andy Reid le llamó después de que el quarterback titular de los Eagles, Donovan McNabb, sufriera una fractura de tobillo en la semana 11 de la temporada 2002 para ofrecerle el puesto de titular, pero Aikman lo rechazó. En 2003, Aikman aceptó jugar para los Miami Dolphins con Turner como coordinador ofensivo y comenzó a entrenar de nuevo, pero el equipo decidió no firmarle un contrato.