En 1959 William Morgan, de Morgan Marine, un constructor de barcos de Silver Bay, en el lago George, Nueva York, adquirió el nombre de Hacker-Craft con el objetivo de revitalizar el legado histórico de la empresa.
Morgan Marine realizó importantes modificaciones estructurales y de ingeniería. El uso de nuevas tecnologías, no disponibles para Hacker, permitió mejorar las embarcaciones en algunos aspectos sutiles pero importantes. Donde Hacker había utilizado motores de 110 CV (82 kW), Morgan Marine pudo impulsar estos cascos con motores Crusader de 350 CV (260 kW) o 454 CV (339 kW) que podían superar las 50 millas por hora. Para acomodar estos motores mejorados, Morgan Marine tuvo que hacer los soportes más fuertes que los utilizados en los diseños originales. Sin embargo, el mayor logro de Morgan fue mejorar el manejo de las embarcaciones Hacker. Si los antiguos Hacker se conducían a velocidades máximas, la proa podía levantarse y bloquear la vista del conductor. Al modificar el diseño del fondo, Morgan se aseguró de que el barco se mantuviera más nivelado en el agua.
En esta época se habían perdido muchas de las plantillas originales y, cuando fue necesario, se hicieron nuevas fundiciones en arena para los herrajes. Aunque conservó la mayor parte de la artesanía tradicional, Morgan introdujo varias mejoras significativas con respecto a los antiguos planos, como concesiones al avance de la tecnología: escapes dobles, en lugar del escape único original, para mejorar el rendimiento del motor; el uso de accesorios y herrajes de acero inoxidable en todo el barco para que las picaduras dejaran de ser un problema; técnicas de encapsulado y pegado de epoxi de última generación; fondos de triple tablón completamente revestidos de epoxi; laterales de doble tablero y cubierta saturados de epoxi; un 25% más de cuadernas; el doble de maderas en el suelo; hasta 18 capas de barniz; el uso de caoba de Honduras de recursos renovables; una nueva dirección mejorada para una mayor maniobrabilidad; y parabrisas laminados con tintes azules o verdes.
En 2004 Robert Wagemann compró la empresa a William Morgan. En 2008 George Badcock’s Erin Investments adquirió una participación mayoritaria en la empresa de Robert Wagemann. Posteriormente, la empresa abrió una planta de producción de 32.000 pies cuadrados en Ticonderoga, trasladando la producción allí desde Silver Bay con el fin de aumentar la capacidad. En 2011, Erin Investments se hizo con la propiedad total de la empresa.
Además de las nuevas instalaciones de producción, el campus de la sede central de la empresa en el lago George, donde también se encuentra un puerto deportivo con todos los servicios, fue mejorado, con una nueva sala de exposiciones con capacidad para mostrar cuatro barcos. Las oficinas de la sede central y todos los edificios de almacenamiento y servicios fueron reparados/reacondicionados. El campus se ajardinó y se mejoraron las zonas de aparcamiento.
En 2011 se pudo ver a Hacker-Craft en sesiones de televisión y catálogos para Marks & Spencer (Reino Unido), Tommy Hilfiger y Nautica.
En 2011 el Hacker-Craft de diseño personalizado Neiman Marcus Edition fue seleccionado como «regalo de fantasía» en el legendario catálogo Neiman Marcus Christmas Book.
En 2012 una asociación con Tommy Bahama dio lugar a un modelo diseñado a medida, el Tommy Bahama Edition Hacker-Craft (TBE).
En 2015 la empresa introdujo una licitación de yate de limusina, y nombró a la Sierra Boat Company, en el lago Tahoe, Nevada, y a la Wawasee Boat Company, de Syracuse, Indiana, como representantes autorizados.
En 2017 la empresa nombró a Classic Boats Lifestyle, Ltd., con sede en Tailandia. (CBL) como distribuidor oficial de stock.
En 2019, un barco Hacker Craft apareció en un episodio de la segunda temporada de la serie Ozark de Netflix.