La especie Homo naledi fue nombrada recientemente a partir de especímenes recuperados en la Cámara Dinaledi del sistema de cuevas Rising Star en Sudáfrica. Esta gran muestra esquelética carece de material faunístico asociado y actualmente no tiene un contexto cronológico conocido. En este trabajo presentamos descripciones exhaustivas y comparaciones métricas del material craneal y mandibular recuperado. Describimos 41 elementos atribuidos a individuos del Homínido Dinaledi (DH1-DH5) y al paratetipo U.W. 101-377, así como 32 fragmentos craneales adicionales. El material de H. naledi fue comparado con los homínidos fósiles del Plio-Pleistoceno mediante análisis cualitativos y cuantitativos que incluyen más de 100 medidas lineales y ratios. Encontramos que la muestra craneal de Dinaledi representa una población anatómicamente homogénea que amplía el rango de variación morfológica atribuible al género Homo. A pesar de una capacidad craneal relativamente pequeña que se encuentra dentro del rango de los australopiths y de unos pocos especímenes de Homo temprano, H. naledi comparte caracteres craneales con especies de todo el género Homo, incluyendo Homo habilis, Homo rudolfensis, Homo erectus y Homo del Pleistoceno medio. Estos incluyen aspectos de la forma craneal, la morfología facial y la anatomía mandibular. Sin embargo, el cráneo de H. naledi se distingue fácilmente de las especies existentes de Homo tanto en evaluaciones cualitativas como cuantitativas. Dado que H. naledi no está fechado actualmente, discutimos las implicaciones evolutivas de su morfología craneal en una serie de marcos cronológicos. Por último, designamos un sexto Hominino Dinaledi (DH6) basado en una mandíbula juvenil.