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Almacenamiento de tejidos FFPE

Las muestras FFPE pueden almacenarse en hospitales, biobancos y centros de investigación. Las instalaciones de almacenamiento suelen mantener registros de cómo se recogió el tejido, los procedimientos de preservación y la información demográfica (como, por ejemplo, el origen, la duración, la edad, la etnia, el sexo y el estadio de la enfermedad) del donante. La información demográfica es un factor importante en la investigación y en los ensayos clínicos. Las muestras de FFPE que se conservan adecuadamente son muy valiosas y pueden almacenarse a temperatura ambiente durante un largo período de tiempo.

Aplicaciones

Las muestras de FFPE son importantes ya que a menudo se utilizan en:

a) Inmunohistoquímica

Las muestras de FFPE seccionadas se montan en un portaobjetos, se bañan en una solución que contiene anticuerpos y, a continuación, se tiñen para que puedan verse más claramente. Este método es importante para los médicos e investigadores que buscan patologías en el tejido, como el Alzheimer o el cáncer.

b) Oncología

Las muestras FFPE son vitales en el campo de la oncología, ya que los tejidos tumorales tienen morfologías características que permiten a los investigadores buscar determinadas proteínas. Estas proteínas se utilizan para ayudar a evaluar el tratamiento y el diagnóstico.

c) Hematología

En el estudio de la sangre y sus trastornos, las muestras de FFPE son importantes para determinar las anomalías y descubrir curas. Las muestras pueden utilizarse en estudios relacionados con la regeneración de tejidos, la genética y la toxicología.

d) Inmunología

Las muestras de FFPE de un donante con una enfermedad autoinmune ayudan a determinar la causa y a desarrollar una terapia para la afección.

Complicaciones o limitaciones

Una de las posibles limitaciones del proceso de fijación con formalina es la potencial desnaturalización de las proteínas presentes en el tejido haciéndolas indetectables para los anticuerpos. Para compensar este problema, se desarrollaron técnicas de recuperación de antígenos. La técnica de recuperación de antígenos recupera específicamente el ADN, el ARN y las proteínas de las muestras FFPE. Para que este método funcione, la calidad de las muestras FFPE es fundamental. También existe el problema de que no hay un procedimiento estándar que se utilice en el procesamiento preanalítico, como la fijación y el aislamiento del ADN. Esto significa que las pequeñas diferencias, como el uso diferente de los instrumentos, la manipulación de las muestras y la metodología, pueden dar lugar a variaciones que afectan a la calidad del ADN y a los resultados del estudio. Algunos de los factores que se han encontrado que afectan a los resultados del estudio de las muestras FFPE son:

1. Registro inexacto del protocolo de fijación

2. Variación del tiempo de fijación

3. Temperatura durante fijación

4. Condiciones de almacenamiento de las muestras FFPE

Control de calidad

Para garantizar la máxima calidad de las muestras FFPE, quienes recogen y almacenan estas muestras deben:

1. Seguir las normas éticas y legales.

2. Mantener un registro claro y preciso de los donantes.

3. Proporcionar información sobre el proceso de toma de muestras y recogida

4. Ser supervisado por un patólogo autorizado durante la recogida de muestras

5. Tener una cadena de custodia completa

6. Trabajar sólo con una red cuidadosamente seleccionada de distribuidores que proporcionan sistemáticamente muestras de alta calidad y precisión

Tejidos congelados frescos

Los tejidos congelados frescos son especímenes que se conservan utilizando nitrógeno líquido mediante un método conocido como «congelación rápida». Estas muestras se almacenan en un congelador a una temperatura inferior a -80 grados Celsius. El tejido fresco congelado tiene diferentes aplicaciones que las muestras de FFPE, ya que pueden utilizarse en estudios de morfología nativa o también en análisis moleculares.

Muestras de FFPE frente a tejido fresco congelado

El FFPE y el tejido fresco congelado tienen sus pros y sus contras. Son dos tipos diferentes de muestras que tienen diferentes usos dependiendo de los requisitos de la investigación o del estudio clínico.

1. Los bloques de FFPE son muy duros y pueden almacenarse fácilmente a temperatura ambiente durante décadas sin necesidad de equipos especiales, lo que hace que el tipo de muestra de tejido sea muy rentable.

2. Hay un gran archivo de muestras de FFPE disponible para los investigadores debido a la facilidad asociada a su almacenamiento.

3. Las muestras de FFPE se han utilizado durante décadas, lo que las hace increíblemente familiares para los patólogos.

4. El tejido congelado fresco es mucho más adecuado para el análisis de proteínas nativas, la reacción en cadena de la polimerasa y la secuenciación del ADN de próxima generación.

5. El tejido congelado fresco garantiza la conservación del ADN, el ARN y las proteínas nativas.

6. Los tejidos congelados frescos requieren un equipo especializado para su almacenamiento. Esto significa que los fallos mecánicos, los cortes de energía y los descuidos pueden afectar a la calidad de las muestras.

1) Ward T. The importance of proper formalin fixation of FFPE samples. Personalis. Consultado el 19/06/2018. https://www.personalis.com/importance-proper-formalin-fixation-ffpe-specimens/

2) Doiron L. 5 reglas de control de calidad para los bancos de tejidos oncológicos. Folio Conversant. Consultado el 19/06/2018. http://www.conversantbio.com/blog/bid/339034/5-Quality-Control-Rules-for-Cancer-Tissue-Banks

3) Muestras de tejido FFPE vs congeladas. BioChain. Consultado el 19/06/2018. https://www.biochain.com/general/ffpe-vs-frozen-tissue-samples/

4) Qué es el tejido FFPE y cuáles son sus usos. BioChain. Consultado el 19/06/2018. https://www.biochain.com/general/what-is-ffpe-tissue/